南京农业大学工学院电气工程系创办于2002年，电类专业办学历史可追溯至1956年南京农学院农业机械化分院农业电气化专业，经过几代人的艰苦努力，电气工程系已经打造了一批勇于探索、充满活力的学术团队，构建了理念先进、制度规范的人才培养体系，形成了教学相长、互促互进的教风学风。电气工程系目前拥有农业电气化、农业智能装备工程（2021年新设，与农业工程系合建)两个本科专业，其中农业电气化为国家一流专业培育点，拥有农业电气化与自动化二级学科博士点。
电气工程系本专业现有专职教师19人，其中教授3人，副教授10人。多名教师荣获江苏省“青蓝工程”青年骨干教师、江苏省“六大人才高峰”高层次人才及南京农业大学钟山学术新秀等荣誉称号。电气工程系注重教研相长。近年来，主持多项国家自然科学基金面上项目和青年基金、江苏省重点研发计划等科研课题，指导学生在诸如全国机器人大赛等国家级比赛中获得50多项奖项。
现任系主任:刘德营 党支部书记:章永年
